MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 18194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002678	TGCA	2	8	614712	614719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_002678	TCA	2	6	618890	618895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_002678	TG	3	6	618900	618905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_002678	CAC	2	6	619742	619747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_002678	GCG	2	6	619758	619763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_002678	CG	3	6	619797	619802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_002678	ACC	2	6	622387	622392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_002678	GAACTC	2	12	623220	623231	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_002678	GCC	2	6	623242	623247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_002678	ATGG	2	8	623283	623290	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_002678	C	6	6	623386	623391	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1512	NC_002678	TACGA	2	10	623400	623409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_002678	CCT	2	6	623424	623429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_002678	TGA	2	6	629937	629942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_002678	GCC	2	6	629975	629980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_002678	GAG	2	6	630125	630130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_002678	GCG	2	6	630191	630196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_002678	CG	3	6	630836	630841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_002678	CGC	2	6	636567	636572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_002678	GATC	2	8	636594	636601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_002678	CAA	2	6	637539	637544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_002678	GGC	2	6	638408	638413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_002678	CGC	2	6	638470	638475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_002678	GCC	2	6	640900	640905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_002678	CAA	2	6	640951	640956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_002678	CGC	3	9	641821	641829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_002678	CA	3	6	644480	644485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_002678	ATG	2	6	644492	644497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_002678	CG	3	6	644498	644503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_002678	GAA	2	6	647835	647840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_002678	GCG	2	6	647908	647913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_002678	CGGCAT	2	12	647916	647927	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_002678	GGAC	2	8	647959	647966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_002678	CG	3	6	647970	647975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_002678	TGA	2	6	647981	647986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_002678	ATT	2	6	648135	648140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_002678	CAA	2	6	648144	648149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_002678	CGG	3	9	648150	648158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_002678	CGC	2	6	648166	648171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_002678	CTG	2	6	650322	650327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_002678	CCGA	2	8	650377	650384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_002678	TCA	2	6	650402	650407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_002678	GGC	2	6	651186	651191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_002678	GAC	2	6	651214	651219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_002678	CGA	2	6	651244	651249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_002678	CAGC	2	8	651289	651296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_002678	GCC	2	6	652379	652384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_002678	CTCG	2	8	652388	652395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_002678	GAA	2	6	653269	653274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_002678	TCG	2	6	653288	653293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_002678	CG	3	6	653318	653323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_002678	ATCG	2	8	653338	653345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_002678	GGT	2	6	653438	653443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_002678	AT	3	6	653449	653454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_002678	GAA	2	6	654800	654805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_002678	CGG	2	6	656250	656255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_002678	CGCC	2	8	656263	656270	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1558	NC_002678	GGC	2	6	656292	656297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_002678	TCAGG	2	10	656381	656390	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_002678	TTGT	2	8	659928	659935	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_002678	GCG	2	6	660275	660280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_002678	TGC	2	6	660291	660296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_002678	GGCC	2	8	665141	665148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_002678	AAC	2	6	667060	667065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_002678	CAAGA	2	10	667087	667096	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1566	NC_002678	TGC	2	6	667111	667116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_002678	CAG	2	6	667166	667171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_002678	G	6	6	667202	667207	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_002678	CGG	2	6	667979	667984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_002678	TG	3	6	668021	668026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_002678	AG	3	6	668085	668090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_002678	CG	3	6	668103	668108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_002678	ACCATA	2	12	668141	668152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_002678	GCC	2	6	668192	668197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_002678	GAA	2	6	668206	668211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_002678	ACC	2	6	668294	668299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_002678	GCC	2	6	668315	668320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_002678	GCC	2	6	668326	668331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_002678	CGGC	2	8	668343	668350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_002678	AAG	2	6	668447	668452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_002678	CGCC	2	8	668526	668533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1582	NC_002678	CGG	2	6	668537	668542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_002678	CGG	2	6	668578	668583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_002678	GGC	2	6	668593	668598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_002678	TCG	2	6	668607	668612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_002678	GCC	2	6	668631	668636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_002678	TGC	2	6	668742	668747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_002678	TCG	2	6	668827	668832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_002678	CG	3	6	668831	668836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_002678	TTC	2	6	668845	668850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_002678	AAG	2	6	674313	674318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1594	NC_002678	CCG	2	6	676947	676952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_002678	CAAA	2	8	677246	677253	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_002678	CGC	2	6	677256	677261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_002678	GCG	2	6	677269	677274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_002678	GCC	2	6	677369	677374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_002678	GGA	2	6	677422	677427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_002678	GTTGG	2	10	677437	677446	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_002678	GCG	2	6	677480	677485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_002678	CG	3	6	677484	677489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_002678	GCG	2	6	677520	677525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_002678	TGA	2	6	677565	677570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_002678	GAA	2	6	677573	677578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_002678	GCC	2	6	677638	677643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_002678	CAA	2	6	677653	677658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1610	NC_002678	CTG	2	6	677776	677781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_002678	CCCG	2	8	677807	677814	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1612	NC_002678	GGC	2	6	680742	680747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_002678	GAAG	2	8	680836	680843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_002678	CCT	2	6	684133	684138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_002678	CGGC	2	8	685828	685835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_002678	CGG	2	6	685839	685844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_002678	TTGC	2	8	685868	685875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_002678	A	6	6	685880	685885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_002678	AAG	2	6	685932	685937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_002678	GAG	2	6	685966	685971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_002678	GCCG	3	12	685988	685999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_002678	GCG	2	6	686020	686025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_002678	CAT	2	6	686034	686039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_002678	TTG	2	6	686182	686187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_002678	CGGCT	2	10	687602	687611	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1626	NC_002678	TCCCG	2	10	688000	688009	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1628	NC_002678	AGC	2	6	688118	688123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_002678	GCAA	2	8	688184	688191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_002678	GAT	2	6	690932	690937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1632	NC_002678	CCA	2	6	690996	691001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_002678	CGA	2	6	691033	691038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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